基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G004580 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:1210057-1210939 (-) |
| 描述 | Similar to AGDP1: Protein AGENET DOMAIN (AGD)-CONTAINING P1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_005940 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g09320 |
异染色质结合蛋白,优先结合长转座子并特异识别组蛋白H3的'赖氨酸-9'甲基化(H3K9me)标记,对二甲基化H3K9(H3K9me2)有更强亲和力。 | |
At1g26540 |
可能通过RNA运输参与植物细胞的极向生长。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006346 | DNA methylation-dependent constitutive heterochromatin formation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.537; 覆盖度=90.741; E 值=2.43e-31; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000325 | plant-type vacuole | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.957; 覆盖度=85.185; E 值=4.02e-18; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000775 | chromosome, centromeric region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.537; 覆盖度=90.741; E 值=2.43e-31; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000792 | heterochromatin | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.537; 覆盖度=90.741; E 值=2.43e-31; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.537; 覆盖度=90.741; E 值=2.43e-31; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042393 | histone binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.537; 覆盖度=90.741; E 值=2.43e-31; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042803 | protein homodimerization activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.957; 覆盖度=85.185; E 值=4.02e-18; UniProt GO evidence=IPI:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0140566 | histone reader activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.537; 覆盖度=90.741; E 值=2.43e-31; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G09320 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.537; 覆盖度=90.741; E 值=2.43e-31 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G26540 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.957; 覆盖度=85.185; E 值=4.02e-18 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |