基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_038870 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr09:52246252-52247203 (-) |
| 描述 | Similar to GATA15: GATA transcription factor 15 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_038870 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 14 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g06740 |
转录调控蛋白,特异性结合基因启动子中的 5'-GATA-3' 或 5'-GAT-3' 基序。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g49300 |
转录调控蛋白,特异性结合基因启动子中的 5'-GATA-3' 或 5'-GAT-3' 基序。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g16870 |
转录调控蛋白,特异性结合基因启动子中的 5'-GATA-3' 或 5'-GAT-3' 基序。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g25830 |
转录激活因子,特异性结合基因启动子内的 5'-GATA-3' 或 5'-GAT-3' 基序。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g26930 |
转录调控蛋白,特异性结合基因启动子中的 5'-GATA-3' 或 5'-GAT-3' 基序。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.194; 覆盖度=59.016; E 值=6.85e-22; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=54.237; 覆盖度=24.18; E 值=2.78e-13; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006357 | regulation of transcription by RNA polymerase II | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=59.574; 覆盖度=19.262; E 值=3.26e-13; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0007623 | circadian rhythm | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=59.574; 覆盖度=19.262; E 值=3.26e-13; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009416 | response to light stimulus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=54.237; 覆盖度=24.18; E 值=2.78e-13; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030154 | cell differentiation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=59.574; 覆盖度=19.262; E 值=3.26e-13; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045893 | positive regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=59.574; 覆盖度=19.262; E 值=3.26e-13; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048527 | lateral root development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=54.237; 覆盖度=24.18; E 值=2.78e-13; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071555 | cell wall organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=59.574; 覆盖度=19.262; E 值=3.26e-13; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1905177 | tracheary element differentiation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=59.574; 覆盖度=19.262; E 值=3.26e-13; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.194; 覆盖度=59.016; E 值=6.85e-22; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.194; 覆盖度=59.016; E 值=6.85e-22; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.194; 覆盖度=59.016; E 值=6.85e-22; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.194; 覆盖度=59.016; E 值=6.85e-22; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G06740 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.194; 覆盖度=59.016; E 值=6.85e-22 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G16870 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.774; 覆盖度=63.525; E 值=3.77e-14 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G25830 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=59.574; 覆盖度=19.262; E 值=3.26e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G26930 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=54.237; 覆盖度=24.18; E 值=2.78e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G49300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=37.41; 覆盖度=56.967; E 值=4.99e-19 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |