基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_038281 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr09:36415707-36421577 (-) |
| 描述 | Similar to RCOM_1767360: Translation factor GUF1 homolog%2C chloroplastic (Ricinus communis OX%3D3988) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_038281 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g08650 |
促进叶绿体蛋白合成。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: B8AI54 |
促进叶绿体蛋白合成。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006412 | translation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.0; 覆盖度=23.148; E 值=5.11e-21; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045727 | positive regulation of translation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.0; 覆盖度=23.148; E 值=5.11e-21; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=84.0; 覆盖度=23.148; E 值=2.22e-20; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.0; 覆盖度=23.148; E 值=5.11e-21; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=84.0; 覆盖度=23.148; E 值=2.22e-20; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003924 | GTPase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.0; 覆盖度=23.148; E 值=5.11e-21; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005525 | GTP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.0; 覆盖度=23.148; E 值=5.11e-21; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019904 | protein domain specific binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=84.0; 覆盖度=23.148; E 值=2.22e-20; UniProt GO evidence=IPI:CAFA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043022 | ribosome binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.0; 覆盖度=23.148; E 值=5.11e-21; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G08650 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=84.0; 覆盖度=23.148; E 值=2.22e-20 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | pop:7465026 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=84.0; 覆盖度=23.148; E 值=1.25e-19 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |