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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDLXL04_037620
当前查询版本OH1004
位置Chr09:16327381-16327879 (-)
描述Similar to DXR: 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase%2C chloroplastic (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_037620 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g62790 质体非甲羟戊酸途径中的异戊二烯类生物合成酶,催化NADPH依赖的1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸(DXP)重排及还原,生成2-C-甲基-D-赤藓醇4-磷酸(MEP)。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0106900 质体非甲羟戊酸途径中的异戊二烯类生物合成酶,催化NADPH依赖的1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸(DXP)重排及还原,生成2-C-甲基-D-赤藓醇4-磷酸(MEP)。 暂无已核实直接文献

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0008299isoprenoid biosynthetic process生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=60.0; 覆盖度=47.619; E 值=1.78e-06; UniProt GO evidence=TAS:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0019288isopentenyl diphosphate biosynthetic process, methylerythritol 4-phosphate pathway生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=60.0; 覆盖度=47.619; E 值=1.78e-06; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0051484isopentenyl diphosphate biosynthetic process, methylerythritol 4-phosphate pathway involved in terpenoid biosynthetic process生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.0; 覆盖度=47.619; E 值=2.9e-08; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafterUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=57.143; 覆盖度=50.0; E 值=3.21e-07; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009570chloroplast stroma细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.0; 覆盖度=47.619; E 值=2.9e-08; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0030145manganese ion binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.0; 覆盖度=47.619; E 值=2.9e-08; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafterUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:00306041-deoxy-D-xylulose-5-phosphate reductoisomerase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.0; 覆盖度=47.619; E 值=2.9e-08; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ECUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0070402NADPH binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.0; 覆盖度=47.619; E 值=2.9e-08; UniProt GO evidence=IEA:InterProUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G62790KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=60.0; 覆盖度=47.619; E 值=1.78e-06UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGdosa:Os01g0106900KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=62.5; 覆盖度=47.619; E 值=2.88e-07UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release