基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_037017 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:51772485-51773149 (+) |
| 描述 | Similar to At1g08880: Probable histone H2AXa (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_037017 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g08880 |
变异组蛋白 H2A,在某些核小体中替代常规 H2A。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g54690 |
变异组蛋白 H2A,在某些核小体中替代常规 H2A。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os12g0530000 |
变异组蛋白 H2A,在某些核小体中替代常规 H2A。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0031507 | heterochromatin formation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=85.385; 覆盖度=92.199; E 值=3.12e-76; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000786 | nucleosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=85.385; 覆盖度=92.199; E 值=3.12e-76; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=85.385; 覆盖度=92.199; E 值=3.12e-76; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=85.385; 覆盖度=92.199; E 值=3.12e-76; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005730 | nucleolus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=85.385; 覆盖度=92.199; E 值=5.52e-76; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=85.385; 覆盖度=92.199; E 值=3.12e-76; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030527 | structural constituent of chromatin | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=85.385; 覆盖度=92.199; E 值=3.12e-76; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046982 | protein heterodimerization activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=85.385; 覆盖度=92.199; E 值=3.12e-76; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G08880 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=85.385; 覆盖度=92.199; E 值=3.12e-76 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G54690 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=85.385; 覆盖度=92.199; E 值=5.52e-76 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | cam:101514555 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=83.846; 覆盖度=92.199; E 值=9.66e-75 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os12g0530000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=85.0; 覆盖度=85.106; E 值=1.16e-68 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |