基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_036140 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:36526913-36531057 (+) |
| 描述 | Similar to LAC7: Laccase-7 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_036140 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g09220 |
木质素降解及木质素衍生产物的解毒。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g01040 |
木质素降解和木质素衍生产物的解毒(通过相似性)。 | |
At5g01050 |
木质素降解及木质素衍生产物的解毒。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g05390 |
木质素降解及木质素衍生产物的解毒。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os12g0259800 |
木质素降解及木质素衍生产物的解毒。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0010228 | vegetative to reproductive phase transition of meristem | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.712; 覆盖度=82.044; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046274 | lignin catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.172; 覆盖度=80.438; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046688 | response to copper ion | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.712; 覆盖度=82.044; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1990641 | response to iron ion starvation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=47.972; 覆盖度=82.774; E 值=2.54e-173; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.172; 覆盖度=80.438; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048046 | apoplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.172; 覆盖度=80.438; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005507 | copper ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.172; 覆盖度=80.438; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016491 | oxidoreductase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.172; 覆盖度=80.438; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0052716 | hydroquinone:oxygen oxidoreductase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.172; 覆盖度=80.438; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G09220 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.172; 覆盖度=80.438; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G01040 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.712; 覆盖度=82.044; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G01050 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=50.088; 覆盖度=82.482; E 值=4.92e-180 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G05390 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=47.972; 覆盖度=82.774; E 值=2.54e-173 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os12g0259800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=50.526; 覆盖度=83.212; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |