基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_035856 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:30703669-30714153 (+) |
| 描述 | Similar to MTERF5: Transcription termination factor MTERF5%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_035856 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g14605 |
质体转录物处理和稳态水平所需的转录终止因子。 | |
At2g21710 |
参与质体转录本加工的转录终止因子(通过相似性)。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g55580 |
质体转录物处理和稳态水平所需的转录终止因子。 | |
At3g60400 |
转录终止因子参与线粒体编码基因表达的调节。 | |
At4g38160 |
对叶绿体发育必需的转录终止因子。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006353 | DNA-templated transcription termination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.296; 覆盖度=20.961; E 值=6.09e-11; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.296; 覆盖度=20.961; E 值=6.09e-11; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006970 | response to osmotic stress | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.296; 覆盖度=20.961; E 值=6.09e-11; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009651 | response to salt stress | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.296; 覆盖度=20.961; E 值=6.09e-11; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009658 | chloroplast organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.296; 覆盖度=20.961; E 值=6.09e-11; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009737 | response to abscisic acid | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.296; 覆盖度=20.961; E 值=6.09e-11; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042793 | plastid transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.296; 覆盖度=20.961; E 值=6.09e-11; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.296; 覆盖度=20.961; E 值=6.09e-11; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=21.951; 覆盖度=23.778; E 值=3.5e-09; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.296; 覆盖度=20.961; E 值=6.09e-11; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003676 | nucleic acid binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=21.951; 覆盖度=23.778; E 值=3.5e-09; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1990837 | sequence-specific double-stranded DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.296; 覆盖度=20.961; E 值=6.09e-11; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G21710 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=21.951; 覆盖度=23.778; E 值=3.5e-09 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G14605 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.296; 覆盖度=20.961; E 值=6.09e-11 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |