基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_035630 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:25667097-25667702 (+) |
| 描述 | Similar to Os09g0568700: Germin-like protein 9-3 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_035630 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
当前来源表未检出该物种的同源命中。
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os09g0568700 |
可能在植物防御中发挥作用。 | 暂无已核实直接文献 |
Os09g0568600 |
可能在植物防御中发挥作用。 | 暂无已核实直接文献 |
Os09g0568500 |
可能在植物防御中发挥作用。 | 暂无已核实直接文献 |
Os05g0277500 |
可能在植物防御中发挥作用。 | 暂无已核实直接文献 |
Os01g0952000 |
可能在植物防御中发挥作用。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0010497 | plasmodesmata-mediated intercellular transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.949; 覆盖度=97.015; E 值=1.94e-35; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000280 | regulation of root development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.949; 覆盖度=97.015; E 值=1.94e-35; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.949; 覆盖度=97.015; E 值=1.94e-35; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048046 | apoplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.128; 覆盖度=93.532; E 值=3.03e-60; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030145 | manganese ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.128; 覆盖度=93.532; E 值=3.03e-60; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | dosa:Os01g0952000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=39.429; 覆盖度=87.065; E 值=1.21e-33 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0277500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.949; 覆盖度=97.015; E 值=1.94e-35 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os09g0568500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=49.451; 覆盖度=90.547; E 值=2.4e-50 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os09g0568700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.128; 覆盖度=93.532; E 值=3.03e-60 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:107277596 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.0; 覆盖度=92.537; E 值=1.01e-53 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |