基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_034793 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:160356-162299 (-) |
| 描述 | Similar to SGO2: SHUGOSHIN 2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_034793 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g04320 |
对减数分裂和有丝分裂细胞周期的进程都是可有可无的。 |
SGO1 but not SGO2 is required for maintenance of centromere cohesion in Arabidopsis thaliana meiosis.2013 · DOI: 10.1007/s00497-013-0231-x
|
At3g10440 |
保护减数分裂Ⅰ中姐妹染色单体着丝粒处的黏连,但并非通过保护黏连蛋白SYN1实现。 |
SGO1 but not SGO2 is required for maintenance of centromere cohesion in Arabidopsis thaliana meiosis.2013 · DOI: 10.1007/s00497-013-0231-x
|
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0799100 |
在减数分裂Ⅰ中保护着丝粒区域的染色体黏连:当前期之后染色体臂上的大部分黏连蛋白复合物(cohesin)解离时,防止该复合物从着丝粒过早解离。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0034090 | maintenance of meiotic sister chromatid cohesion | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.556; 覆盖度=31.69; E 值=7.09e-26; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045144 | meiotic sister chromatid segregation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.556; 覆盖度=31.69; E 值=7.09e-26; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051301 | cell division | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.912; 覆盖度=47.887; E 值=2.49e-22; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000775 | chromosome, centromeric region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.556; 覆盖度=31.69; E 值=7.09e-26; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.556; 覆盖度=31.69; E 值=7.09e-26; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005730 | nucleolus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.912; 覆盖度=47.887; E 值=2.49e-22; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G10440 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=42.012; 覆盖度=59.507; E 值=4.47e-25 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G04320 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.556; 覆盖度=31.69; E 值=7.09e-26 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0799100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.912; 覆盖度=47.887; E 值=2.49e-22 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | zma:606461 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.805; 覆盖度=57.746; E 值=1.42e-21 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |