基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_034332 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr07:96734739-96738160 (-) |
| 描述 | Similar to LNK2: Protein LNK2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_034332 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g54500 |
时钟基因 PRR5 和 TOC1 表达所必需的转录共激活因子。 |
LNK genes integrate light and clock signaling networks at the core of the Arabidopsis oscillator.2013 · DOI: 10.1073/pnas.1302170110
|
At5g64170 |
转录共激活因子，对时钟基因 PRR5 和 TOC1 的表达必不可少。 |
LNK genes integrate light and clock signaling networks at the core of the Arabidopsis oscillator.2013 · DOI: 10.1073/pnas.1302170110
|
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.019; 覆盖度=52.393; E 值=3.79e-23; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006354 | DNA-templated transcription elongation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.977; 覆盖度=21.914; E 值=4.23e-13; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.019; 覆盖度=52.393; E 值=3.79e-23; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009649 | entrainment of circadian clock | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.019; 覆盖度=52.393; E 值=3.79e-23; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032922 | circadian regulation of gene expression | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.019; 覆盖度=52.393; E 值=3.79e-23; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.019; 覆盖度=52.393; E 值=3.79e-23; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003712 | transcription coregulator activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.019; 覆盖度=52.393; E 值=3.79e-23; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0070063 | RNA polymerase binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.977; 覆盖度=21.914; E 值=4.23e-13; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G54500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.019; 覆盖度=52.393; E 值=3.79e-23 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G64170 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.977; 覆盖度=21.914; E 值=4.23e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |