基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_030345 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:114720221-114727009 (+) |
| 描述 | Similar to WEB1: Protein WEAK CHLOROPLAST MOVEMENT UNDER BLUE LIGHT 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_030345 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g26570 |
高强度蓝光下叶绿体回避反应所需。 | |
At4g33390 |
蓝光下叶绿体运动减弱相关蛋白样蛋白1(WEAK CHLOROPLAST MOVEMENT UNDER BLUE LIGHT-like 1)。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g42880 |
蓝光下叶绿体运动减弱相关蛋白样蛋白3(WEAK CHLOROPLAST MOVEMENT UNDER BLUE LIGHT-like 3)。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g45545 |
蓝光下叶绿体运动减弱相关蛋白样蛋白2(WEAK CHLOROPLAST MOVEMENT UNDER BLUE LIGHT-like 2)。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g55860 |
WEB 家族蛋白 At5g55860。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009903 | chloroplast avoidance movement | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.318; 覆盖度=74.19; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009904 | chloroplast accumulation movement | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.318; 覆盖度=74.19; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071260 | cellular response to mechanical stimulus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=25.74; 覆盖度=78.241; E 值=5.15e-09; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=52.818; 覆盖度=71.875; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005777 | peroxisome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.318; 覆盖度=74.19; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.318; 覆盖度=74.19; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009536 | plastid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=25.74; 覆盖度=78.241; E 值=5.15e-09; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G45545 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=45.037; 覆盖度=78.125; E 值=1.2e-140 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G26570 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.318; 覆盖度=74.19; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G33390 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=52.818; 覆盖度=71.875; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G42880 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=46.429; 覆盖度=74.537; E 值=7.58e-148 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G55860 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=25.74; 覆盖度=78.241; E 值=5.15e-09 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |