基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

示例 TkA01G624900 LXL04_000258 文献示例 LXL04_039733 TkAUNG001940

查询结果

基因 ID	`LXL04_029590`
当前查询版本	OH1004
位置	Chr06:94924760-94926028 (+)
描述	Similar to ISPF: 2-C-methyl-D-erythritol 2%2C4-cyclodiphosphate synthase%2C chloroplastic (Catharanthus roseus OX%3D4058)
注释来源组装	GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029590 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g63970`	用于类异戊二烯生物合成的质体非甲羟戊酸途径的酶，将 4-二磷酸胞苷基-2C-甲基-D-赤藓醇 2-磷酸转化为 2C-甲基-D-赤藓醇 2,4-环二磷酸和 CMP。	Functional evidence for the involvement of Arabidopsis IspF homolog in the nonmevalonate pathway of plastid isoprenoid biosynthesis.2006 · DOI: 10.1007/s00425-005-0140-9

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os02g0680600`	胞质体非甲羟戊酸途径异戊二烯生物合成的酶，将4-二磷胞苷基-2C-甲基-D-赤藓糖醇-2-磷酸转化为2C-甲基-D-赤藓糖醇-2,4-环二磷酸和CMP（可能）。	A single nucleotide mutation of IspF gene involved in the MEP pathway for isoprenoid biosynthesis causes yellow-green leaf phenotype in rice.2018 · DOI: 10.1007/s11103-017-0668-7

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型	ID	名称	命名空间	证据	来源
GO	GO:0015995	chlorophyll biosynthetic process	生物过程	Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=89.017; 覆盖度=74.892; E 值=2.5e-112; UniProt GO evidence=IMP:TAIR	UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GO	GO:0016114	terpenoid biosynthetic process	生物过程	Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.529; 覆盖度=103.03; E 值=1.68e-112; UniProt GO evidence=IEA:InterPro	UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GO	GO:0016117	carotenoid biosynthetic process	生物过程	Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=89.017; 覆盖度=74.892; E 值=2.5e-112; UniProt GO evidence=IMP:TAIR	UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GO	GO:0019288	isopentenyl diphosphate biosynthetic process, methylerythritol 4-phosphate pathway	生物过程	Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.529; 覆盖度=103.03; E 值=1.68e-112; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway	UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GO	GO:0009507	chloroplast	细胞组分	Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=89.017; 覆盖度=74.892; E 值=2.5e-112; UniProt GO evidence=HDA:TAIR	UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GO	GO:0009570	chloroplast stroma	细胞组分	Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.529; 覆盖度=103.03; E 值=1.68e-112; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell	UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GO	GO:0008685	2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase activity	分子功能	Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.529; 覆盖度=103.03; E 值=1.68e-112; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC	UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GO	GO:0046872	metal ion binding	分子功能	Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.529; 覆盖度=103.03; E 值=1.68e-112; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW	UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGG	ath:AT1G63970	KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending		Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=89.017; 覆盖度=74.892; E 值=2.5e-112	UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGG	bav:BAV1059	KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending		Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=52.83; 覆盖度=68.831; E 值=1.4e-51	UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGG	dosa:Os02g0680600	KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending		Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=70.259; 覆盖度=100.433; E 值=2.48e-105	UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGG	gwc:GWCH70_0087	KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending		Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=51.592; 覆盖度=67.965; E 值=1.3e-51	UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release