基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_029415 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:89776343-89778365 (+) |
| 描述 | Similar to At1g34110: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g34110 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_029415 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 21 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g34110 |
与 RGI1、RGI2、RGI3 和 RGI4 一起,作为 RGF1 的受体,RGF1 是一种通过调节转录因子 PLETHORA (PLT) 的表达水平和模式来维持胚后根干细胞区的肽激素。 | |
At3g24240 |
与 RGI2、RGI3、RGI4 和 RGI5 一起,作为 RGF 肽(如 RGF1、GLV5/CLEL1/RGF2、GLV7/CLEL3/RGF3、GLV3/RGF4、GLV10/CLEL7/RGF5 和 RGF10/CLELN)的受体,这些肽激素通过调控转录因子 PLETHORA(PLT,例如 PLT1 和 PLT2)的表达水平和模式来维持胚后根干细胞的生态位。 | |
At5g48940 |
与RGI1、RGI3、RGI4和RGI5一起,作为RGF肽(例如 RGF1、GLV5/CLEL1/RGF2、GLV7/CLEL3/RGF3、GLV3/RGF4、GLV10/CLEL7/RGF5 和 RGF10/CLELN)的受体,这些肽激素通过调控转录因子PLETHORA(PLT,例如PLT1和PLT2)的表达水平和模式,维持胚后根干细胞利基。 | |
At4g28650 |
参与调控维管组织发育过程中原形成层的维持和极性。 | |
At5g61480 |
与CLE41p、CLE44p肽构成配体-受体对,参与维管组织发育中的信号转导,调控原形成层的维持及极性。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006468 | protein phosphorylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=38.889; 覆盖度=44.554; E 值=1.69e-14; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009755 | hormone-mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.13; 覆盖度=45.545; E 值=9.39e-30; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010067 | procambium histogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=38.889; 覆盖度=44.554; E 值=1.69e-14; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010074 | maintenance of meristem identity | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.13; 覆盖度=45.545; E 值=9.39e-30; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010078 | maintenance of root meristem identity | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=44.34; 覆盖度=52.475; E 值=1.85e-18; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010082 | regulation of root meristem growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.13; 覆盖度=45.545; E 值=9.39e-30; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010087 | phloem or xylem histogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=38.889; 覆盖度=44.554; E 值=1.69e-14; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010183 | pollen tube guidance | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=38.889; 覆盖度=44.554; E 值=1.69e-14; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010449 | root meristem growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=44.34; 覆盖度=52.475; E 值=1.85e-18; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030154 | cell differentiation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=38.889; 覆盖度=44.554; E 值=1.69e-14; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046777 | protein autophosphorylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=38.889; 覆盖度=44.554; E 值=1.69e-14; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000280 | regulation of root development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=44.34; 覆盖度=52.475; E 值=1.85e-18; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.13; 覆盖度=45.545; E 值=9.39e-30; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0090406 | pollen tube | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=38.889; 覆盖度=44.554; E 值=1.69e-14; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0001653 | peptide receptor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.13; 覆盖度=45.545; E 值=9.39e-30; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004672 | protein kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=38.889; 覆盖度=44.554; E 值=1.69e-14; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004674 | protein serine/threonine kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.13; 覆盖度=45.545; E 值=9.39e-30; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.13; 覆盖度=45.545; E 值=9.39e-30; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0038023 | signaling receptor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.13; 覆盖度=45.545; E 值=9.39e-30; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042277 | peptide binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=44.34; 覆盖度=52.475; E 值=1.85e-18; UniProt GO evidence=IPI:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0106310 | protein serine kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.13; 覆盖度=45.545; E 值=9.39e-30; UniProt GO evidence=IEA:RHEA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G34110 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.13; 覆盖度=45.545; E 值=9.39e-30 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G24240 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=44.34; 覆盖度=52.475; E 值=1.85e-18 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G28650 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=38.889; 覆盖度=44.554; E 值=1.69e-14 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G48940 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=45.37; 覆盖度=53.465; E 值=2.58e-18 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |