基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_028860 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:71389257-71394379 (-) |
| 描述 | Protein of unknown function |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_028860 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g32010 |
参与胚胎途径的基因表达转录抑制因子,例如 LEC1、ABI3 和 FUS3。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0347300 |
在GST拉下来实验中结合组蛋白H3K4me1、H3K4me2和H3K4me3。 | 暂无已核实直接文献 |
Os07g0669800 |
转录激活因子,作为籽粒大小的正调控因子。 | 暂无已核实直接文献 |
Os05g0371100 |
在GST拉下来实验中结合组蛋白H3K4me1、H3K4me2和H3K4me3。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.662; 覆盖度=22.295; E 值=2.09e-36; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045893 | positive regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.841; 覆盖度=19.59; E 值=1.05e-35; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080113 | regulation of seed growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.841; 覆盖度=19.59; E 值=1.05e-35; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.662; 覆盖度=22.295; E 值=2.09e-36; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.662; 覆盖度=22.295; E 值=2.09e-36; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043565 | sequence-specific DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.841; 覆盖度=19.59; E 值=1.05e-35; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | dosa:Os03g0347300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.662; 覆盖度=22.295; E 值=2.09e-36 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os07g0669800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.841; 覆盖度=19.59; E 值=1.05e-35 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4344236 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.841; 覆盖度=19.59; E 值=1.05e-35 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |