基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_028456 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:42364262-42367565 (+) |
| 描述 | Similar to Os04g0609600: Probable protein phosphatase 2C 44 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_028456 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 13 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g28400 |
可能的蛋白质磷酸酶 2C 58。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g20630 |
可能参与防御信号传导。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g22280 |
参与光敏色素信号传导的调控。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0609600 |
可能的蛋白磷酸酶2C 44。 | 暂无已核实直接文献 |
Os07g0507000 |
可能的蛋白磷酸酶 2C 62。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006470 | protein dephosphorylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=61.508; 覆盖度=86.897; E 值=1.16e-117; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0007165 | signal transduction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.357; 覆盖度=96.552; E 值=3.04e-171; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010161 | red light signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=61.508; 覆盖度=86.897; E 值=1.16e-117; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1902531 | regulation of intracellular signal transduction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=62.544; 覆盖度=97.586; E 值=3.46e-126; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=61.508; 覆盖度=86.897; E 值=1.16e-117; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=62.544; 覆盖度=97.586; E 值=3.46e-126; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=62.544; 覆盖度=97.586; E 值=3.46e-126; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=61.508; 覆盖度=86.897; E 值=1.16e-117; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=62.544; 覆盖度=97.586; E 值=3.46e-126; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010494 | cytoplasmic stress granule | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=61.151; 覆盖度=95.862; E 值=2.03e-119; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004721 | phosphoprotein phosphatase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=61.508; 覆盖度=86.897; E 值=1.16e-117; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004722 | protein serine/threonine phosphatase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.357; 覆盖度=96.552; E 值=3.04e-171; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.357; 覆盖度=96.552; E 值=3.04e-171; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G22280 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=61.508; 覆盖度=86.897; E 值=1.16e-117 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G20630 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=61.151; 覆盖度=95.862; E 值=2.03e-119 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G28400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=62.544; 覆盖度=97.586; E 值=3.46e-126 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0609600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.357; 覆盖度=96.552; E 值=3.04e-171 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os07g0507000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=61.484; 覆盖度=97.586; E 值=9.02e-120 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |