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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDLXL04_028230
当前查询版本OH1004
位置Chr06:35287091-35289064 (-)
描述Similar to At4g30620: Nucleoid-associated protein At4g30620%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_028230 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g30620 结合DNA并改变其构象。 暂无已核实直接文献
At2g24020 与ALB4一起参与类囊体蛋白的靶向。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0045037protein import into chloroplast stroma生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=75.912; 覆盖度=69.543; E 值=8.33e-68; UniProt GO evidence=IGI:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005773vacuole细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=75.912; 覆盖度=69.543; E 值=8.33e-68; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005829cytosol细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=45.631; 覆盖度=52.284; E 值=1.56e-18; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafterUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005886plasma membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.834; 覆盖度=76.65; E 值=1.9e-71; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.834; 覆盖度=76.65; E 值=1.9e-71; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009535chloroplast thylakoid membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=75.912; 覆盖度=69.543; E 值=8.33e-68; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009570chloroplast stroma细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.834; 覆盖度=76.65; E 值=1.9e-71; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009941chloroplast envelope细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.834; 覆盖度=76.65; E 值=1.9e-71; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003677DNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.834; 覆盖度=76.65; E 值=1.9e-71; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGana:alr5067KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=45.631; 覆盖度=52.284; E 值=4.68e-18UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G24020KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=75.912; 覆盖度=69.543; E 值=8.33e-68UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G30620KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.834; 覆盖度=76.65; E 值=1.9e-71UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGsyc:syc1054_dKEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=45.631; 覆盖度=52.284; E 值=1.56e-18UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGsyf:Synpcc7942_0464KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=45.631; 覆盖度=52.284; E 值=1.56e-18UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release