基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_027446 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:16166332-16167292 (+) |
| 描述 | Similar to At4g18930: Cyclic phosphodiesterase (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_027446 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 1 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006388 | tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.101; 覆盖度=81.735; E 值=1.07e-71; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009187 | cyclic nucleotide metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.101; 覆盖度=81.735; E 值=1.07e-71; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.101; 覆盖度=81.735; E 值=1.07e-71; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.101; 覆盖度=81.735; E 值=1.07e-71; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004112 | cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.101; 覆盖度=81.735; E 值=1.07e-71; UniProt GO evidence=IDA:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004113 | 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.101; 覆盖度=81.735; E 值=1.07e-71; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G18930 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.101; 覆盖度=81.735; E 值=1.07e-71 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |