基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_025745 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:116359355-116360734 (+) |
| 描述 | Similar to LA1: Protein LAZY 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_025745 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os11g0490600 |
通过负调控向下极性生长素运输(PAT)参与茎重力性和分蘖角度的调控。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009630 | gravitropism | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=26.269; 覆盖度=123.77; E 值=4.97e-19; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009958 | positive gravitropism | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.676; 覆盖度=101.093; E 值=7.3e-43; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009959 | negative gravitropism | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.676; 覆盖度=101.093; E 值=7.3e-43; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000012 | regulation of auxin polar transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.676; 覆盖度=101.093; E 值=7.3e-43; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.676; 覆盖度=101.093; E 值=7.3e-43; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.676; 覆盖度=101.093; E 值=7.3e-43; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G14090 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.676; 覆盖度=101.093; E 值=7.3e-43 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os11g0490600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=25.523; 覆盖度=130.601; E 值=2.58e-16 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | zma:100193776 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=26.269; 覆盖度=123.77; E 值=4.97e-19 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |