基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_024539 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:93382041-93383533 (+) |
| 描述 | Similar to ATHB-40: Homeobox-leucine zipper protein ATHB-40 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_024539 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g36740 |
可能的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g18550 |
可能的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g66700 |
可能在根发育过程中通过调节生长素/细胞分裂素信号发挥调控作用的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os07g0581700 |
可能的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: A2YN17 |
可能的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.768; 覆盖度=101.932; E 值=1.95e-74; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009725 | response to hormone | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=54.225; 覆盖度=68.599; E 值=2.66e-41; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009733 | response to auxin | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.768; 覆盖度=101.932; E 值=1.95e-74; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045893 | positive regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.768; 覆盖度=101.932; E 值=1.95e-74; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048364 | root development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=60.256; 覆盖度=75.362; E 值=1.66e-53; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.768; 覆盖度=101.932; E 值=1.95e-74; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.768; 覆盖度=101.932; E 值=1.95e-74; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000981 | DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.768; 覆盖度=101.932; E 值=1.95e-74; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=60.256; 覆盖度=75.362; E 值=1.66e-53; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.768; 覆盖度=101.932; E 值=1.95e-74; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043565 | sequence-specific DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.768; 覆盖度=101.932; E 值=1.95e-74; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G18550 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=55.349; 覆盖度=103.865; E 值=1.13e-71 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G36740 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.768; 覆盖度=101.932; E 值=1.95e-74 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G66700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=60.256; 覆盖度=75.362; E 值=1.66e-53 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os07g0581700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=54.225; 覆盖度=68.599; E 值=2.66e-41 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |