基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_024269 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:86245388-86247080 (+) |
| 描述 | Similar to Os03g0767500: Thioredoxin-like protein HCF164%2C chloroplastic (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_024269 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g37200 |
硫醇二硫化物氧化还原酶,参与叶绿体中的各种氧化还原反应。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0767500 |
可能的硫醇-二硫化物氧化还原酶,可能参与叶绿体中的各种氧化还原反应。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0010190 | cytochrome b6f complex assembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.429; 覆盖度=81.579; E 值=6.94e-109; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=34.043; 覆盖度=35.338; E 值=1.13e-12; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=65.044; 覆盖度=84.962; E 值=4.03e-105; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=65.044; 覆盖度=84.962; E 值=4.03e-105; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009534 | chloroplast thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=65.044; 覆盖度=84.962; E 值=4.03e-105; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.429; 覆盖度=81.579; E 值=6.94e-109; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031977 | thylakoid lumen | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.429; 覆盖度=81.579; E 值=6.94e-109; UniProt GO evidence=IEA:EnsemblPlants | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015035 | protein-disulfide reductase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=34.043; 覆盖度=35.338; E 值=1.13e-12; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016671 | oxidoreductase activity, acting on a sulfur group of donors, disulfide as acceptor | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.429; 覆盖度=81.579; E 值=6.94e-109; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G37200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=65.044; 覆盖度=84.962; E 值=4.03e-105 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0767500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.429; 覆盖度=81.579; E 值=6.94e-109 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | syf:Synpcc7942_1830 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=34.043; 覆盖度=35.338; E 值=1.13e-12 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | syf:Synpcc7942_2128 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=41.606; 覆盖度=51.504; E 值=4.99e-32 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | syn:sll1980 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.728; 覆盖度=65.038; E 值=1.31e-37 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |