基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_022917 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:13586090-13587367 (+) |
| 描述 | Similar to DRT100: DNA damage-repair/toleration protein DRT100 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_022917 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g12610 |
该蛋白能够补偿细菌 recA 突变,但其在植物中的本体功能尚不清楚。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g51740 |
可能不活跃的富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 IMK2。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g20140 |
与GSO2共同参与胚胎和子叶表皮表面发育所需的受体样丝氨酸/苏氨酸激酶。 |
GASSHO1 and GASSHO2 encoding a putative leucine-rich repeat transmembrane-type receptor kinase are essential for the normal development of the epidermal surface in Arabidopsis embryos.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03395.x
|
At3g56100 |
能磷酸化 AGL24。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g49660 |
受体激酶参与 C 末端编码的植物信号肽 的感知以及根和芽发育的后续调节。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006281 | DNA repair | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.152; 覆盖度=77.647; E 值=2.62e-32; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0007165 | signal transduction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.152; 覆盖度=77.647; E 值=2.62e-32; UniProt GO evidence=IC:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.152; 覆盖度=77.647; E 值=2.62e-32; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009505 | plant-type cell wall | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=33.714; 覆盖度=82.353; E 值=3.05e-30; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=33.714; 覆盖度=82.353; E 值=3.05e-30; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.152; 覆盖度=77.647; E 值=2.62e-32; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000166 | nucleotide binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.152; 覆盖度=77.647; E 值=2.62e-32; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004672 | protein kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=33.714; 覆盖度=82.353; E 值=3.05e-30; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=33.714; 覆盖度=82.353; E 值=3.05e-30; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G12610 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.152; 覆盖度=77.647; E 值=2.62e-32 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G51740 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=33.714; 覆盖度=82.353; E 值=3.05e-30 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |