基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_022652 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:4127645-4129137 (-) |
| 描述 | Similar to At3g61320: UPF0187 protein At3g61320%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_022652 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g61320 |
电压依赖性氯 通道对于质子动力 在照明期间通过阴离子流入管腔在类囊体膜上的分配至关重要,因此需要在波动的光照条件下进行光保护。 | |
At2g45870 |
电压依赖氯(Cl)通道,可能通过阴离子流入腔体参与类囊体膜上的质子驱动力(PMF)分配。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006811 | monoatomic ion transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=30.851; 覆盖度=67.303; E 值=2.29e-24; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010027 | thylakoid membrane organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.966; 覆盖度=83.055; E 值=4.46e-166; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019684 | photosynthesis, light reaction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.966; 覆盖度=83.055; E 值=4.46e-166; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042548 | regulation of photosynthesis, light reaction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.966; 覆盖度=83.055; E 值=4.46e-166; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.966; 覆盖度=83.055; E 值=4.46e-166; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.966; 覆盖度=83.055; E 值=4.46e-166; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009533 | chloroplast stromal thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.966; 覆盖度=83.055; E 值=4.46e-166; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.966; 覆盖度=83.055; E 值=4.46e-166; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0034707 | chloride channel complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.966; 覆盖度=83.055; E 值=4.46e-166; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042651 | thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.966; 覆盖度=83.055; E 值=4.46e-166; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005247 | voltage-gated chloride channel activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.966; 覆盖度=83.055; E 值=4.46e-166; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ana:alr2987 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=30.851; 覆盖度=67.303; E 值=2.29e-24 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G45870 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=64.365; 覆盖度=86.396; E 值=1.37e-160 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G61320 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.966; 覆盖度=83.055; E 值=4.46e-166 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mlo:mll4386 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=26.471; 覆盖度=56.802; E 值=1.67e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | syn:sll1024 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=30.303; 覆盖度=55.131; E 值=1.69e-23 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |