基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_022138 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:145198850-145200906 (+) |
| 描述 | Similar to ORRM1: Organelle RRM domain-containing protein 1%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_022138 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 6 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g20930 |
参与叶绿体 RNA 的 C 到 U 编辑。 | |
At1g73530 |
参与叶绿体 RNA 的 C 到 U 编辑。 | |
At5g06210 |
可能的RNA结合蛋白，可能参与盐胁迫和氧化胁迫耐受。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0730800 |
参与叶绿体 RNA 的 C 到 U 编辑。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006397 | mRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.051; 覆盖度=77.419; E 值=4.45e-120; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009409 | response to cold | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.051; 覆盖度=77.419; E 值=4.45e-120; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016554 | cytidine to uridine editing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.051; 覆盖度=77.419; E 值=4.45e-120; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080156 | mitochondrial mRNA modification | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.051; 覆盖度=77.419; E 值=4.45e-120; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1900871 | chloroplast mRNA modification | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.051; 覆盖度=77.419; E 值=4.45e-120; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1901002 | positive regulation of response to salt stress | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=44.898; 覆盖度=24.318; E 值=4.42e-18; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=44.898; 覆盖度=24.318; E 值=4.42e-18; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.051; 覆盖度=77.419; E 值=4.45e-120; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.051; 覆盖度=77.419; E 值=4.45e-120; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.051; 覆盖度=77.419; E 值=4.45e-120; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.051; 覆盖度=77.419; E 值=4.45e-120; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G73530 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=50.562; 覆盖度=22.084; E 值=7.53e-21 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G20930 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.051; 覆盖度=77.419; E 值=4.45e-120 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G06210 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=44.898; 覆盖度=24.318; E 值=4.42e-18 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0730800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=53.049; 覆盖度=81.39; E 值=9.51e-108 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4330618 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=53.049; 覆盖度=81.39; E 值=9.51e-108 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | zma:100304402 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=52.795; 覆盖度=79.901; E 值=1.26e-107 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |