基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_021438 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:129761614-129765900 (-) |
| 描述 | Similar to GABA-TP3: Gamma aminobutyrate transaminase 3%2C chloroplastic (Solanum lycopersicum OX%3D4081) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_021438 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
当前来源表未检出该物种的同源命中。
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0614600 |
转氨酶,降解γ-氨基丁酸(GABA),以丙酮酸作为氨基受体,但不使用2-氧代戊二酸。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: B8BBZ7 |
降解 γ-氨基丁酸 (GABA) 的转氨酶。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: Q01K11 |
转氨酶,降解γ-氨基丁酸(GABA),以丙酮酸作为氨基受体,但不使用2-氧代戊二酸。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009102 | biotin biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.078; 覆盖度=101.392; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009448 | gamma-aminobutyric acid metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.078; 覆盖度=101.392; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009821 | alkaloid biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.078; 覆盖度=101.392; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=77.526; 覆盖度=96.421; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.078; 覆盖度=101.392; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004015 | adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate transaminase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.078; 覆盖度=101.392; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030170 | pyridoxal phosphate binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.078; 覆盖度=101.392; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0034387 | 4-aminobutyrate:pyruvate transaminase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.078; 覆盖度=101.392; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | dosa:Os04g0614600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=75.776; 覆盖度=96.024; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sly:543873 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=77.526; 覆盖度=96.421; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |