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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDLXL04_021359
当前查询版本OH1004
位置Chr04:128149630-128150175 (-)
描述Similar to VQ8: VQ motif-containing protein 8%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_021359 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g68450 可能参与叶绿体发育。 暂无已核实直接文献
At3g18360 可能作为植物防御的负调控因子。 暂无已核实直接文献
At3g18690 植物防御反应的调控因子。
At1g21320 可选择性剪接(AS)调控因子,结合特定mRNA并调节生长素对转录组的影响。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0002758innate immune response-activating signaling pathway生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=33.684; 覆盖度=52.486; E 值=2.62e-08; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0006952defense response生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.909; 覆盖度=30.387; E 值=1.09e-08; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0080092regulation of pollen tube growth生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.909; 覆盖度=30.387; E 值=1.09e-08; UniProt GO evidence=IGI:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.548; 覆盖度=85.635; E 值=4.05e-17; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.548; 覆盖度=85.635; E 值=4.05e-17; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016607nuclear speck细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=39.474; 覆盖度=41.989; E 值=1.36e-07; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003729mRNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=39.474; 覆盖度=41.989; E 值=1.36e-07; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G21320KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=39.474; 覆盖度=41.989; E 值=1.36e-07UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G68450KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.548; 覆盖度=85.635; E 值=4.05e-17UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G18360KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.909; 覆盖度=30.387; E 值=1.09e-08UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G18690KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=33.684; 覆盖度=52.486; E 值=2.62e-08UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release