基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_021118 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:122039887-122041685 (+) |
| 描述 | Similar to CLPF: Clp protease adapter protein ClpF%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_021118 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g03390 |
Clp 蛋白酶适配器，促进 CLPS1 募集到 ClpC 伴侣，从而形成用于选择性底物识别和递送到质体 Clp 蛋白酶系统 的二元适配器。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006511 | ubiquitin-dependent protein catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=33.636; 覆盖度=33.333; E 值=5.14e-10; UniProt GO evidence=NAS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019221 | cytokine-mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=33.636; 覆盖度=33.333; E 值=4.25e-10; UniProt GO evidence=IMP:MGI | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031146 | SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=33.636; 覆盖度=33.333; E 值=5.14e-10; UniProt GO evidence=NAS:ComplexPortal | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0061484 | hematopoietic stem cell homeostasis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=33.636; 覆盖度=33.333; E 值=4.25e-10; UniProt GO evidence=IMP:MGI | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0070371 | ERK1 and ERK2 cascade | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=33.636; 覆盖度=33.333; E 值=4.25e-10; UniProt GO evidence=IMP:MGI | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000151 | ubiquitin ligase complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=33.636; 覆盖度=33.333; E 值=5.14e-10; UniProt GO evidence=NAS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.939; 覆盖度=100.0; E 值=1.59e-147; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=33.636; 覆盖度=33.333; E 值=5.14e-10; UniProt GO evidence=TAS:Reactome | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.939; 覆盖度=100.0; E 值=1.59e-147; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009840 | chloroplastic endopeptidase Clp complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.939; 覆盖度=100.0; E 值=1.59e-147; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.939; 覆盖度=100.0; E 值=1.59e-147; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004842 | ubiquitin-protein transferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=33.636; 覆盖度=33.333; E 值=5.14e-10; UniProt GO evidence=NAS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G03390 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.939; 覆盖度=100.0; E 值=1.59e-147 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | hsa:23014 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=33.636; 覆盖度=33.333; E 值=5.14e-10 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mmu:231670 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=33.636; 覆盖度=33.333; E 值=4.25e-10 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |