基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_021115 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:122007043-122009353 (+) |
| 描述 | Similar to RLP12: Receptor-like protein 12 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_021115 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 4 条 GO 注释和 1 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g71400 |
参与CLV3及CLV3样肽的感知,这些肽作为调节分生组织维护的细胞外信号。 | |
At3g11080 |
类受体蛋白 35。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g17230 |
富含亮氨酸重复序列的受体样丝/苏氨酸蛋白激酶 At1g17230。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g25790 |
具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性的受体(通过相似性)。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0618700 |
构成模式识别受体(PPR),决定对鞭毛蛋白(flg22)的特异性识别,flg22是引发对病原相关分子模式(PAMPs)防御反应的有效诱导因子。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0007165 | signal transduction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=31.006; 覆盖度=108.485; E 值=4.18e-39; UniProt GO evidence=IC:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010073 | meristem maintenance | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=31.006; 覆盖度=108.485; E 值=4.18e-39; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=31.006; 覆盖度=108.485; E 值=4.18e-39; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=31.006; 覆盖度=108.485; E 值=4.18e-39; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G71400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=31.006; 覆盖度=108.485; E 值=4.18e-39 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |