本页使用教程

基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

下载当前结果

基因 IDLXL04_020923
当前查询版本OH1004
位置Chr04:115172423-115172986 (+)
描述Similar to ATL46: RING-H2 finger protein ATL46 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_020923 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g40250 RING-H2 指蛋白 ATL46。 暂无已核实直接文献
At1g23980 RING-H2指蛋白ATL47。 暂无已核实直接文献
At2g18650 可能参与雌配子体发育。 暂无已核实直接文献
At3g48030 RING-H2 指蛋白 ATL48。 暂无已核实直接文献
At4g30400 RING-H2 指蛋白 ATL13。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0009793embryo development ending in seed dormancy生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=43.216; 覆盖度=106.417; E 值=1.38e-39; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016567protein ubiquitination生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.093; 覆盖度=103.743; E 值=1.26e-55; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathwayUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.093; 覆盖度=103.743; E 值=1.26e-55; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005886plasma membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=69.767; 覆盖度=45.989; E 值=1.33e-34; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016020membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.093; 覆盖度=103.743; E 值=1.26e-55; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0008270zinc ion binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.093; 覆盖度=103.743; E 值=1.26e-55; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0061630ubiquitin protein ligase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.093; 覆盖度=103.743; E 值=1.26e-55; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ECUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G23980KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=57.534; 覆盖度=78.075; E 值=3.42e-48UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G18650KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=43.216; 覆盖度=106.417; E 值=1.38e-39UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G48030KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=47.368; 覆盖度=81.283; E 值=4.2e-39UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G30400KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=69.767; 覆盖度=45.989; E 值=1.33e-34UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G40250KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.093; 覆盖度=103.743; E 值=1.26e-55UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release