基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_020855 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:111508331-111509325 (-) |
| 描述 | Similar to KNAT6: Homeobox protein knotted-1-like 6 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_020855 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g23380 |
在分生组织功能中发挥作用。 | |
At1g70510 |
可能在分生组织功能中发挥作用,并可能参与维持细胞处于未分化的分生组织状态。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0302500 |
可能的转录因子,可能参与早期胚胎发生中的芽形成。 | 暂无已核实直接文献 |
Os05g0129700 |
可能的转录因子,可能参与胚胎发育期间的芽形成。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: A2Y007 |
可能的转录因子,可能参与胚胎发育期间的芽形成。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006357 | regulation of transcription by RNA polymerase II | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.377; 覆盖度=95.833; E 值=2.35e-46; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009736 | cytokinin-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.455; 覆盖度=91.667; E 值=5.34e-42; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010073 | meristem maintenance | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.377; 覆盖度=95.833; E 值=2.35e-46; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010094 | specification of carpel identity | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.455; 覆盖度=91.667; E 值=5.34e-42; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.377; 覆盖度=95.833; E 值=2.35e-46; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.377; 覆盖度=95.833; E 值=2.35e-46; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000978 | RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.377; 覆盖度=95.833; E 值=2.35e-46; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000981 | DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.377; 覆盖度=95.833; E 值=2.35e-46; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=52.066; 覆盖度=56.019; E 值=6.29e-27; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.377; 覆盖度=95.833; E 值=2.35e-46; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G23380 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.377; 覆盖度=95.833; E 值=2.35e-46 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G70510 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.455; 覆盖度=91.667; E 值=5.34e-42 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0302500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=54.128; 覆盖度=50.463; E 值=4.83e-31 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0129700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=52.066; 覆盖度=56.019; E 值=6.29e-27 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |