基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_019875 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:42755077-42759629 (-) |
| 描述 | Similar to SCAMP1: Secretory carrier-associated membrane protein 1 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_019875 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g61250 |
可能参与膜运输。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g20840 |
可能参与膜运输。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g03550 |
可能参与膜运输。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os07g0564600 |
可能参与膜运输。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: A2YMP7 |
可能参与膜运输。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0015031 | protein transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.798; 覆盖度=101.656; E 值=5.28e-155; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=68.932; 覆盖度=102.318; E 值=1.58e-151; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005768 | endosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=68.932; 覆盖度=102.318; E 值=1.58e-151; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005769 | early endosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.798; 覆盖度=101.656; E 值=5.28e-155; UniProt GO evidence=IDA:Gramene | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005794 | Golgi apparatus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=68.932; 覆盖度=102.318; E 值=1.58e-151; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005802 | trans-Golgi network | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=68.932; 覆盖度=102.318; E 值=1.58e-151; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.798; 覆盖度=101.656; E 值=5.28e-155; UniProt GO evidence=IDA:Gramene | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030658 | transport vesicle membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.798; 覆盖度=101.656; E 值=5.28e-155; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032588 | trans-Golgi network membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.798; 覆盖度=101.656; E 值=5.28e-155; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0055038 | recycling endosome membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.798; 覆盖度=101.656; E 值=5.28e-155; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G03550 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=67.987; 覆盖度=100.331; E 值=4.48e-144 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G61250 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=68.932; 覆盖度=102.318; E 值=1.58e-151 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G20840 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=70.627; 覆盖度=100.331; E 值=3.71e-148 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os07g0564600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.798; 覆盖度=101.656; E 值=5.28e-155 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |