基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_019003 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:21709352-21711873 (+) |
| 描述 | Similar to IAA27: Auxin-responsive protein IAA27 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_019003 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g29080 |
Aux/IAA 蛋白是短命转录因子,在低生长素浓度下充当早期生长素响应基因的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g22670 |
Aux/IAA 蛋白是短命转录因子,在低生长素浓度下充当早期生长素响应基因的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g65670 |
Aux/IAA 蛋白是短命转录因子,在低生长素浓度下充当早期生长素响应基因的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g14550 |
Aux/IAA 蛋白是短命转录因子,在低生长素浓度下充当早期生长素响应基因的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g04730 |
Aux/IAA 蛋白是短命转录因子,在低生长素浓度下充当早期生长素响应基因的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.632; 覆盖度=104.778; E 值=5.42e-109; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009733 | response to auxin | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.632; 覆盖度=104.778; E 值=5.42e-109; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009734 | auxin-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.632; 覆盖度=104.778; E 值=5.42e-109; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010102 | lateral root morphogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=49.442; 覆盖度=91.809; E 值=6.82e-76; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010311 | lateral root formation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.75; 覆盖度=109.215; E 值=2.69e-91; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045892 | negative regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.75; 覆盖度=109.215; E 值=2.69e-91; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1901332 | negative regulation of lateral root development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.75; 覆盖度=109.215; E 值=2.69e-91; UniProt GO evidence=IMP:CACAO | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.632; 覆盖度=104.778; E 值=5.42e-109; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.75; 覆盖度=109.215; E 值=2.69e-91; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.632; 覆盖度=104.778; E 值=5.42e-109; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.632; 覆盖度=104.778; E 值=5.42e-109; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042802 | identical protein binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=49.643; 覆盖度=95.563; E 值=5.77e-74; UniProt GO evidence=IPI:IntAct | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G22670 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.75; 覆盖度=109.215; E 值=2.69e-91 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G04730 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=49.643; 覆盖度=95.563; E 值=5.77e-74 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G14550 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=49.442; 覆盖度=91.809; E 值=6.82e-76 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G29080 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.632; 覆盖度=104.778; E 值=5.42e-109 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G65670 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=44.345; 覆盖度=114.676; E 值=1.46e-78 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |