基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_018745 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:17518617-17521624 (+) |
| 描述 | Similar to RUS2: Protein root UVB sensitive 2%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_018745 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g31190 |
参与根 UV-B 传感通路并防止对极低注量率 UV-B 过敏。 | |
At5g49820 |
对正常胚胎发育必需。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g45890 |
参与根 UV-B 传感通路并防止对极低注量率 UV-B 过敏。 |
Role of root UV-B sensing in Arabidopsis early seedling development.2008 · DOI: 10.1073/pnas.0809942106
|
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009926 | auxin polar transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.735; 覆盖度=97.647; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010224 | response to UV-B | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.735; 覆盖度=97.647; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032502 | developmental process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=27.246; 覆盖度=81.176; E 值=5.7e-35; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=33.651; 覆盖度=74.118; E 值=1.67e-42; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009536 | plastid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.735; 覆盖度=97.647; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009941 | chloroplast envelope | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.735; 覆盖度=97.647; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=27.822; 覆盖度=89.647; E 值=5.06e-33; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031969 | chloroplast membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=27.246; 覆盖度=81.176; E 值=5.7e-35; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G31190 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.735; 覆盖度=97.647; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G45890 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=27.246; 覆盖度=81.176; E 值=5.7e-35 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G49820 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=33.651; 覆盖度=74.118; E 值=1.67e-42 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mmu:233913 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=27.822; 覆盖度=89.647; E 值=5.06e-33 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | rno:361654 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=26.649; 覆盖度=89.176; E 值=7.91e-33 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |