基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_018428 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:12767621-12768762 (+) |
| 描述 | Similar to Os04g0584300: Probable protein phosphatase 2C 43 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_018428 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g12620 |
可能去磷酸化并抑制质膜 H⁺-ATP 酶（PM H⁺-ATP 酶，例如 AHA1 和 AHA2），从而对植物生长和适应性产生负面影响（通过相似性）。 | |
At3g55050 |
可能去磷酸化并抑制质膜H⁺-ATP酶（PM H⁺-ATP酶，例如AHA1和AHA2），从而对植物生长和适应性产生负面影响。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0832400 |
可能的蛋白磷酸酶2C 36。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: Q7XUC5 |
可能的蛋白磷酸酶2C 43。 | 暂无已核实直接文献 |
Os02g0685600 |
可能的蛋白质磷酸酶2C 25。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:1900425 | negative regulation of defense response to bacterium | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=27.16; 覆盖度=98.182; E 值=3e-23; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1902531 | regulation of intracellular signal transduction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.746; 覆盖度=99.091; E 值=2e-23; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=27.16; 覆盖度=98.182; E 值=3e-23; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004722 | protein serine/threonine phosphatase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.746; 覆盖度=99.091; E 值=2e-23; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.746; 覆盖度=99.091; E 值=2e-23; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G12620 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=27.16; 覆盖度=98.182; E 值=3e-23 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G55050 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=27.16; 覆盖度=98.182; E 值=1.32e-22 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0685600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=29.022; 覆盖度=96.061; E 值=5.77e-23 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0832400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.746; 覆盖度=99.091; E 值=2e-23 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |