基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_018052 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:5666373-5667062 (+) |
| 描述 | Similar to PR-1: Pathogenesis-related protein PR-1 (Medicago truncatula OX%3D3880) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_018052 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006952 | defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.447; 覆盖度=93.064; E 值=3.86e-52; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0098542 | defense response to other organism | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.102; 覆盖度=84.971; E 值=6e-58; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.102; 覆盖度=84.971; E 值=6e-58; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005615 | extracellular space | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.447; 覆盖度=93.064; E 值=3.86e-52; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005773 | vacuole | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=43.902; 覆盖度=94.798; E 值=5.78e-46; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | mtr:11441780 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.102; 覆盖度=84.971; E 值=6e-58 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | nta:107763263 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=43.902; 覆盖度=94.798; E 值=5.78e-46 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |