基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_017936 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:3951681-3953713 (-) |
| 描述 | Similar to SPL12: Squamosa promoter-binding-like protein 12 (Oryza sativa subsp. indica OX%3D39946) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_017936 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 14 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g27360 |
与共有核苷酸序列 5'-TNCGTACAA-3' 特异性结合的反式作用因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g27370 |
与共有核苷酸序列 5'-TNCGTACAA-3' 特异性结合的反式作用因子。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: A2YGR5 |
特异性结合共有核苷酸序列5′-TNCGTACAA-3′的反式作用因子(基于相似性推测)。 | 暂无已核实直接文献 |
Os06g0703500 |
特异性结合共有核苷酸序列5′-TNCGTACAA-3′的反式作用因子(基于相似性推测)。 | 暂无已核实直接文献 |
Os02g0139400 |
特异性结合共有核苷酸序列5′-TNCGTACAA-3′的反式作用因子(基于相似性推测)。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.429; 覆盖度=49.62; E 值=9.56e-48; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.801; 覆盖度=73.671; E 值=1.37e-42; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010262 | somatic embryogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.801; 覆盖度=73.671; E 值=1.37e-42; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010358 | leaf shaping | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=39.338; 覆盖度=68.861; E 值=1.46e-42; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045893 | positive regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=39.338; 覆盖度=68.861; E 值=1.46e-42; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048510 | regulation of timing of transition from vegetative to reproductive phase | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.801; 覆盖度=73.671; E 值=1.37e-42; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0090356 | negative regulation of auxin metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.801; 覆盖度=73.671; E 值=1.37e-42; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.429; 覆盖度=49.62; E 值=9.56e-48; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=46.429; 覆盖度=49.62; E 值=1.01e-47; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0001216 | DNA-binding transcription activator activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=46.429; 覆盖度=49.62; E 值=1.01e-47; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.429; 覆盖度=49.62; E 值=9.56e-48; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.801; 覆盖度=73.671; E 值=1.37e-42; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.429; 覆盖度=49.62; E 值=9.56e-48; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043565 | sequence-specific DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=39.338; 覆盖度=68.861; E 值=1.46e-42; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G27360 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.801; 覆盖度=73.671; E 值=1.37e-42 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G27370 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=39.338; 覆盖度=68.861; E 值=1.46e-42 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0703500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=46.429; 覆盖度=49.62; E 值=1.01e-47 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4341986 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=46.429; 覆盖度=49.62; E 值=1.01e-47 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:9270639 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=33.788; 覆盖度=74.177; E 值=3.12e-41 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |