基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_017902 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:3240100-3241749 (+) |
| 描述 | Similar to PMR5: Protein PMR5 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_017902 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g58600 |
在植物-微生物相互作用期间,需要非宿主抗性(NHR)。 | |
At2g30010 |
可能作为桥联蛋白,结合果胶及其他细胞壁多糖。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g29050 |
可能作为桥联蛋白,结合果胶及其他细胞壁多糖。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g34070 |
可能作为桥联蛋白,结合果胶及其他细胞壁多糖。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g42570 |
可能作为桥联蛋白,结合果胶及其他细胞壁多糖。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006952 | defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.756; 覆盖度=88.432; E 值=3.68e-166; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009620 | response to fungus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.756; 覆盖度=88.432; E 值=3.68e-166; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009827 | plant-type cell wall modification | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=51.94; 覆盖度=86.118; E 值=8.12e-122; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009867 | jasmonic acid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=51.94; 覆盖度=86.118; E 值=8.12e-122; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005773 | vacuole | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=47.472; 覆盖度=91.517; E 值=1.1e-119; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005783 | endoplasmic reticulum | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.756; 覆盖度=88.432; E 值=3.68e-166; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005794 | Golgi apparatus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.756; 覆盖度=88.432; E 值=3.68e-166; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=47.472; 覆盖度=91.517; E 值=1.1e-119; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.756; 覆盖度=88.432; E 值=3.68e-166; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016413 | O-acetyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.756; 覆盖度=88.432; E 值=3.68e-166; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043565 | sequence-specific DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=51.94; 覆盖度=86.118; E 值=8.12e-122; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G29050 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=50.137; 覆盖度=93.83; E 值=2.97e-126 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G30010 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=55.191; 覆盖度=94.087; E 值=3.06e-150 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G34070 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=51.94; 覆盖度=86.118; E 值=8.12e-122 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G42570 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=47.472; 覆盖度=91.517; E 值=1.1e-119 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G58600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.756; 覆盖度=88.432; E 值=3.68e-166 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |