基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_017308 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:146012867-146016865 (+) |
| 描述 | Similar to rsmE: Ribosomal RNA small subunit methyltransferase E (Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) OX%3D1111708) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_017308 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 4 条 GO 注释和 6 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0070475 | rRNA base methylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.045; 覆盖度=79.643; E 值=1.03e-14; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.045; 覆盖度=79.643; E 值=1.03e-14; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016301 | kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.045; 覆盖度=79.643; E 值=1.03e-14; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0070042 | rRNA (uridine-N3-)-methyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.045; 覆盖度=79.643; E 值=1.03e-14; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | aae:aq_165 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.276; 覆盖度=51.786; E 值=8.69e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | bas:BUsg_395 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=24.885; 覆盖度=77.5; E 值=6.02e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | bsu:BSU25440 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=25.292; 覆盖度=91.786; E 值=3.2e-11 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mtu:Rv2372c | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=29.004; 覆盖度=82.5; E 值=7.79e-11 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mtv:RVBD_2372c | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=29.004; 覆盖度=82.5; E 值=7.79e-11 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | syn:slr0722 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.045; 覆盖度=79.643; E 值=1.03e-14 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |