基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_017077 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:140643634-140650282 (+) |
| 描述 | Similar to At1g22040: F-box/kelch-repeat protein At1g22040 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_017077 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g22040 |
F-box/kelch重复蛋白At1g22040。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g55270 |
F-box/kelch重复蛋白At1g55270。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g30090 |
F-box/kelch重复蛋白 At1g30090。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g24540 |
SCF(ASK- cullin-F-box)E3泛素连接酶复合体的组分,可能介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解(通过相似性)。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g67480 |
F-盒/kelch重复蛋白 At1g67480。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006995 | cellular response to nitrogen starvation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=27.397; 覆盖度=53.676; E 值=6.28e-22; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009585 | red, far-red light phototransduction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=25.915; 覆盖度=52.206; E 值=1.09e-27; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010017 | red or far-red light signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=25.915; 覆盖度=52.206; E 值=1.09e-27; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=25.915; 覆盖度=52.206; E 值=1.09e-27; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000762 | regulation of phenylpropanoid metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=27.727; 覆盖度=64.706; E 值=1.3e-33; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=27.727; 覆盖度=64.706; E 值=1.3e-33; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.783; 覆盖度=49.559; E 值=1.06e-32; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.113; 覆盖度=69.265; E 值=1.9e-175; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G22040 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.113; 覆盖度=69.265; E 值=1.9e-175 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G30090 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.783; 覆盖度=49.559; E 值=1.06e-32 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G55270 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=27.727; 覆盖度=64.706; E 值=1.3e-33 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G67480 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=27.397; 覆盖度=53.676; E 值=6.28e-22 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G24540 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=25.915; 覆盖度=52.206; E 值=1.09e-27 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |