基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_016977 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:138283094-138287578 (-) |
| 描述 | Similar to Elongation factor 1-gamma (Prunus avium OX%3D42229) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_016977 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 13 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g57720 |
可能在将复合物固定到其他细胞组分中起作用。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g09640 |
可能在将复合物固定到其他细胞组分中起作用。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0220500 |
可能在将复合物固定到其他细胞组分中起作用。 | 暂无已核实直接文献 |
Os02g0220600 |
可能在将复合物固定到其他细胞组分中起作用。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0010043 | response to zinc ion | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=48.106; 覆盖度=46.643; E 值=6.19e-70; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000325 | plant-type vacuole | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=48.106; 覆盖度=46.643; E 值=6.19e-70; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=49.798; 覆盖度=43.64; E 值=1.16e-68; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=48.106; 覆盖度=46.643; E 值=6.19e-70; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=49.798; 覆盖度=43.64; E 值=1.16e-68; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005773 | vacuole | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=49.798; 覆盖度=43.64; E 值=1.16e-68; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=48.106; 覆盖度=46.643; E 值=6.19e-70; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009505 | plant-type cell wall | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=48.106; 覆盖度=46.643; E 值=6.19e-70; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=48.106; 覆盖度=46.643; E 值=6.19e-70; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010494 | cytoplasmic stress granule | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=48.106; 覆盖度=46.643; E 值=6.19e-70; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003746 | translation elongation factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.362; 覆盖度=45.406; E 值=2.87e-77; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004364 | glutathione transferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.362; 覆盖度=45.406; E 值=2.87e-77; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005507 | copper ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=48.106; 覆盖度=46.643; E 值=6.19e-70; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G09640 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=49.798; 覆盖度=43.64; E 值=1.16e-68 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G57720 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=48.106; 覆盖度=46.643; E 值=6.19e-70 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0220600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=49.049; 覆盖度=46.466; E 值=3.8e-70 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |