基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_016951 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:137438100-137440862 (-) |
| 描述 | Similar to truA: tRNA pseudouridine synthase A (Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) OX%3D78245) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_016951 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 3 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0031119 | tRNA pseudouridine synthesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=36.364; 覆盖度=84.153; E 值=1.06e-50; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=36.364; 覆盖度=84.153; E 值=1.06e-50; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0160147 | tRNA pseudouridine(38-40) synthase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=36.364; 覆盖度=84.153; E 值=1.06e-50; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | mag:amb0241 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=34.74; 覆盖度=84.153; E 值=1.04e-49 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | pla:Plav_0263 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.54; 覆盖度=84.426; E 值=2.2e-49 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | rfe:RF_1356 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=34.74; 覆盖度=84.153; E 值=1.14e-50 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | rri:A1G_07265 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=33.766; 覆盖度=84.153; E 值=2.74e-49 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | xau:Xaut_3303 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=36.364; 覆盖度=84.153; E 值=1.06e-50 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |