基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_016893 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:136284454-136286925 (-) |
| 描述 | Similar to PAP4: Probable plastid-lipid-associated protein 4%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_016893 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g26070 |
可能的质体脂质相关蛋白4,叶绿体。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g26080 |
可能的质体脂类相关蛋白5,叶绿体型。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g19940 |
可能的质体脂质相关蛋白 8,叶绿体型。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0422000 |
通过与茄尼基二磷酸合酶SPS2互作,参与质体醌-9(PQ-9)生物合成,并对此过程必不可少。 | |
Os09g0133600 |
可能的质体脂质相关蛋白2,叶绿体。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0010117 | photoprotection | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=27.778; 覆盖度=73.72; E 值=1.16e-10; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010236 | plastoquinone biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.967; 覆盖度=83.276; E 值=1.01e-12; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.182; 覆盖度=75.085; E 值=6.37e-84; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.182; 覆盖度=75.085; E 值=6.37e-84; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009534 | chloroplast thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.182; 覆盖度=75.085; E 值=6.37e-84; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.182; 覆盖度=75.085; E 值=6.37e-84; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009536 | plastid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=28.409; 覆盖度=60.068; E 值=5.34e-09; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009579 | thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=28.409; 覆盖度=60.068; E 值=5.34e-09; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009941 | chloroplast envelope | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=28.409; 覆盖度=60.068; E 值=5.34e-09; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010287 | plastoglobule | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.182; 覆盖度=75.085; E 值=6.37e-84; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G26070 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.182; 覆盖度=75.085; E 值=6.37e-84 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G26080 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=52.653; 覆盖度=83.618; E 值=2.63e-77 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G19940 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=28.409; 覆盖度=60.068; E 值=5.34e-09 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0422000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.967; 覆盖度=83.276; E 值=1.01e-12 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4335835 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.967; 覆盖度=83.276; E 值=1.01e-12 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |