基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_016619 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:129358962-129363436 (+) |
| 描述 | Similar to LSH10: Protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 10 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_016619 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g42610 |
可能的转录调控因子,通过响应光促进细胞生长作为发育调控因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g07090 |
可能的转录调控因子,通过响应光促进细胞生长作为发育调控因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g78815 |
可能的转录调控因子,通过响应光促进细胞生长作为发育调控因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g18610 |
可能的转录调控因子,通过响应光促进细胞生长作为发育调控因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g16910 |
可能的转录调控因子,通过响应光促进细胞生长作为发育调控因子。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009299 | mRNA transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.795; 覆盖度=47.937; E 值=2.45e-81; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009416 | response to light stimulus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.795; 覆盖度=47.937; E 值=2.45e-81; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0090698 | post-embryonic plant morphogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.795; 覆盖度=47.937; E 值=2.45e-81; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.795; 覆盖度=47.937; E 值=2.45e-81; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=71.324; 覆盖度=43.175; E 值=1.76e-68; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.795; 覆盖度=47.937; E 值=2.45e-81; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G07090 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=70.199; 覆盖度=47.937; E 值=5.3e-74 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G16910 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=71.324; 覆盖度=43.175; E 值=1.76e-68 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G78815 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=75.352; 覆盖度=45.079; E 值=5.97e-74 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G42610 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.795; 覆盖度=47.937; E 值=2.45e-81 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G18610 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=79.365; 覆盖度=40.0; E 值=1.9e-70 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |