基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_015905 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:97305553-97308610 (+) |
| 描述 | Similar to DOT3: BTB/POZ domain-containing protein DOT3 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_015905 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g10250 |
可能作为 E3 泛素蛋白连接酶复合体 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配器,介导目标蛋白的泛素化及随后通过蛋白酶体降解 (通过相似性推测)。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g30440 |
可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子,介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g67385 |
可能作为E3泛素蛋白连接酶复合体(CUL3-RBX1-BTB)的底物特异性衔接蛋白,介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g66560 |
可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子,介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g13600 |
可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子,介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009904 | chloroplast accumulation movement | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.226; 覆盖度=82.914; E 值=2.42e-90; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010087 | phloem or xylem histogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.805; 覆盖度=92.986; E 值=1.2e-180; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010305 | leaf vascular tissue pattern formation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.805; 覆盖度=92.986; E 值=1.2e-180; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010588 | cotyledon vascular tissue pattern formation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.805; 覆盖度=92.986; E 值=1.2e-180; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.805; 覆盖度=92.986; E 值=1.2e-180; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042742 | defense response to bacterium | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.226; 覆盖度=82.914; E 值=2.42e-90; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048367 | shoot system development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.805; 覆盖度=92.986; E 值=1.2e-180; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080022 | primary root development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.805; 覆盖度=92.986; E 值=1.2e-180; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=34.572; 覆盖度=96.763; E 值=1.86e-91; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=34.572; 覆盖度=96.763; E 值=1.86e-91; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=38.445; 覆盖度=83.273; E 值=1.28e-87; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G30440 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=34.572; 覆盖度=96.763; E 值=1.86e-91 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G10250 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.805; 覆盖度=92.986; E 值=1.2e-180 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G13600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.126; 覆盖度=82.554; E 值=4.1e-88 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G66560 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=38.445; 覆盖度=83.273; E 值=1.28e-87 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G67385 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.226; 覆盖度=82.914; E 值=2.42e-90 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |