基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_015809 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:86563425-86565867 (+) |
| 描述 | Similar to rlmI: Ribosomal RNA large subunit methyltransferase I (Erwinia tasmaniensis (strain DSM 17950 / CIP 109463 / Et1/99) OX%3D465817) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_015809 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 3 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.39; 覆盖度=93.182; E 值=2.69e-64; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.39; 覆盖度=93.182; E 值=2.69e-64; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016434 | rRNA (cytosine) methyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.39; 覆盖度=93.182; E 值=2.69e-64; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | aha:AHA_2227 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=33.333; 覆盖度=92.727; E 值=7.19e-62 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | amc:MADE_1008550 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=33.661; 覆盖度=92.5; E 值=2.82e-61 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | asa:ASA_2074 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=33.827; 覆盖度=92.045; E 值=5.2e-63 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | eta:ETA_20930 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.39; 覆盖度=93.182; E 值=2.69e-64 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ppr:PBPRA2194 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=34.085; 覆盖度=90.682; E 值=9.25e-61 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |