基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_014719 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:55486680-55489299 (-) |
| 描述 | Similar to ISPE: 4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase%2C chloroplastic/chromoplastic (Fragment) (Solanum lycopersicum OX%3D4081) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_014719 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g26930 |
类异戊二烯生物合成质体非甲羟戊酸途径的酶,催化 4-二磷酸胞苷基-2C-甲基-D-赤藓糖醇 2 位羟基的磷酸化。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0802100 |
类异戊二烯生物合成质体非甲羟戊酸途径的酶,催化 4-二磷酸胞苷基-2C-甲基-D-赤藓糖醇 2 位羟基的磷酸化。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0016114 | terpenoid biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.387; 覆盖度=87.136; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019288 | isopentenyl diphosphate biosynthetic process, methylerythritol 4-phosphate pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.387; 覆盖度=87.136; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.387; 覆盖度=87.136; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009509 | chromoplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.387; 覆盖度=87.136; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=68.766; 覆盖度=96.359; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.387; 覆盖度=87.136; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0050515 | 4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=79.387; 覆盖度=87.136; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G26930 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=75.588; 覆盖度=82.524; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0802100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=68.766; 覆盖度=96.359; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |