基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_014642 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:54275456-54280273 (+) |
| 描述 | Similar to HEMH: Ferrochelatase-2%2C chloroplastic (Oryza sativa subsp. indica OX%3D39946) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_014642 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g30390 |
催化血红素生物合成的最后一步,通过将亚铁插入原卟啉IX生成原血红素。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: A2Y3Q5 |
催化亚铁插入原卟啉IX中。 | 暂无已核实直接文献 |
Os05g0361200 |
催化亚铁插入原卟啉IX中。 | 暂无已核实直接文献 |
Os09g0297000 |
催化亚铁插入原卟啉IX中。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006779 | porphyrin-containing compound biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=82.609; 覆盖度=77.345; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006783 | heme biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.388; 覆盖度=82.124; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0033014 | tetrapyrrole biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=82.609; 覆盖度=77.345; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.388; 覆盖度=82.124; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005777 | peroxisome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=82.609; 覆盖度=77.345; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.388; 覆盖度=82.124; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=82.609; 覆盖度=77.345; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031969 | chloroplast membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=82.609; 覆盖度=77.345; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0055035 | plastid thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=82.609; 覆盖度=77.345; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004325 | ferrochelatase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.388; 覆盖度=82.124; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G30390 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=82.609; 覆盖度=77.345; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0361200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=80.388; 覆盖度=82.124; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os09g0297000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=65.013; 覆盖度=67.788; E 值=2.21e-172 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |