基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_014616 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:53838131-53838891 (-) |
| 描述 | Similar to RPL28: 50S ribosomal protein L28%2C chloroplastic (Nicotiana tabacum OX%3D4097) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_014616 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006412 | translation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=93.421; 覆盖度=33.778; E 值=5.01e-46; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005783 | endoplasmic reticulum | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=74.286; 覆盖度=46.667; E 值=8.37e-46; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005840 | ribosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=93.421; 覆盖度=33.778; E 值=5.01e-46; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=93.421; 覆盖度=33.778; E 值=5.01e-46; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=74.286; 覆盖度=46.667; E 值=8.37e-46; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009941 | chloroplast envelope | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=74.286; 覆盖度=46.667; E 值=8.37e-46; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1990904 | ribonucleoprotein complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=93.421; 覆盖度=33.778; E 值=5.01e-46; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=74.286; 覆盖度=46.667; E 值=8.37e-46; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003735 | structural constituent of ribosome | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=93.421; 覆盖度=33.778; E 值=5.01e-46; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G33450 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=74.286; 覆盖度=46.667; E 值=8.37e-46 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | cyn:Cyan7425_0615 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=64.0; 覆盖度=33.333; E 值=1.5e-28 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |