基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_014411 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:48680643-48681119 (-) |
| 描述 | Similar to OFP6: Transcription repressor OFP6 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_014411 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g52525 |
转录阻遏蛋白,通过调节 BEL1-LIKE (BLH) 和 KNOX TALE (KNAT) 同源域转录因子来调节植物生长和发育的多个方面。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g19650 |
转录阻遏蛋白,通过调节 BEL1-LIKE (BLH) 和 KNOX TALE (KNAT) 同源域转录因子来调节植物生长和发育的多个方面。 | |
At2g18500 |
转录阻遏蛋白,通过调节 BEL1-LIKE (BLH) 和 KNOX TALE (KNAT) 同源域转录因子来调节植物生长和发育的多个方面。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g18830 |
转录阻遏蛋白,通过调节 BEL1-LIKE (BLH) 和 KNOX TALE (KNAT) 同源域转录因子来调节植物生长和发育的多个方面。 |
A central role of Arabidopsis thaliana ovate family proteins in networking and subcellular localization of 3-aa loop extension homeodomain proteins.2005 · DOI: 10.1073/pnas.0501181102
|
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0864000 |
可能的转录抑制因子,部分通过油菜素甾醇(BR)信号通路调控植物生长发育的多个方面。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=44.966; 覆盖度=94.304; E 值=7.81e-30; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009553 | embryo sac development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=42.105; 覆盖度=48.101; E 值=4.26e-14; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009742 | brassinosteroid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=52.308; 覆盖度=41.139; E 值=3.5e-17; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043622 | cortical microtubule organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=42.105; 覆盖度=48.101; E 值=4.26e-14; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045892 | negative regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=44.966; 覆盖度=94.304; E 值=7.81e-30; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1900457 | regulation of brassinosteroid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=52.308; 覆盖度=41.139; E 值=3.5e-17; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=44.966; 覆盖度=94.304; E 值=7.81e-30; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005730 | nucleolus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=42.105; 覆盖度=48.101; E 值=4.26e-14; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=52.308; 覆盖度=41.139; E 值=3.5e-17; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030863 | cortical cytoskeleton | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=42.105; 覆盖度=48.101; E 值=4.26e-14; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G18500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=52.381; 覆盖度=39.873; E 值=1.38e-15 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G52525 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=44.966; 覆盖度=94.304; E 值=7.81e-30 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G18830 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=42.105; 覆盖度=48.101; E 值=4.26e-14 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G19650 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=53.03; 覆盖度=41.772; E 值=5.84e-18 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0864000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=52.308; 覆盖度=41.139; E 值=3.5e-17 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |