基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_013364 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:28594322-28595158 (-) |
| 描述 | Similar to ZHD8: Zinc-finger homeodomain protein 8 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_013364 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g15210 |
推测的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g28920 |
推测的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g69600 |
参与上调多种应激诱导基因的转录因子。 | |
At2g02540 |
推测的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os09g0414600 |
推测的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=44.177; 覆盖度=89.568; E 值=4.95e-44; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=44.177; 覆盖度=89.568; E 值=4.95e-44; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009414 | response to water deprivation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.387; 覆盖度=79.856; E 值=1.77e-37; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019760 | glucosinolate metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=44.177; 覆盖度=89.568; E 值=4.95e-44; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045893 | positive regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.387; 覆盖度=79.856; E 值=1.77e-37; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=44.177; 覆盖度=89.568; E 值=4.95e-44; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=44.177; 覆盖度=89.568; E 值=4.95e-44; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=44.177; 覆盖度=89.568; E 值=4.95e-44; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=44.177; 覆盖度=89.568; E 值=4.95e-44; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=44.177; 覆盖度=89.568; E 值=4.95e-44; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042803 | protein homodimerization activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=44.177; 覆盖度=89.568; E 值=4.95e-44; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G69600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.387; 覆盖度=79.856; E 值=1.77e-37 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G02540 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.021; 覆盖度=85.252; E 值=2.62e-36 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G28920 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.363; 覆盖度=98.201; E 值=1.56e-38 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G15210 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=44.177; 覆盖度=89.568; E 值=4.95e-44 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |