基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_013291 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:27184569-27187197 (+) |
| 描述 | Similar to FDH1: Formate dehydrogenase%2C mitochondrial (Solanum tuberosum OX%3D4113) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_013291 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g14780 |
催化 NAD(+)-依赖的甲酸氧化为二氧化碳的反应。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os06g0486800 |
催化 NAD(+)-依赖的甲酸氧化为二氧化碳的反应。 | 暂无已核实直接文献 |
Os06g0486900 |
催化 NAD(+)-依赖的甲酸氧化为二氧化碳的反应。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009611 | response to wounding | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=79.692; 覆盖度=99.235; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042183 | formate catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=85.052; 覆盖度=98.98; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=85.052; 覆盖度=98.98; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=79.692; 覆盖度=99.235; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=85.052; 覆盖度=98.98; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009536 | plastid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=79.692; 覆盖度=99.235; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009579 | thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=79.692; 覆盖度=99.235; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008863 | formate dehydrogenase (NAD+) activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=85.052; 覆盖度=98.98; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016616 | oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=85.052; 覆盖度=98.98; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051287 | NAD binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=85.052; 覆盖度=98.98; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G14780 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=79.692; 覆盖度=99.235; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0486900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=76.842; 覆盖度=96.939; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sot:102577429 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=85.052; 覆盖度=98.98; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |